Die Stiftung ist flexibel beim Einsatz benötigter Mittel, kann auch ausländische Wissenschaftler in eine Projektkooperation einbeziehen helfen und unterstützt vielfach Projekte, an welchen deutsche und ausländische Wissenschaftler gemeinsam arbeiten. In gleicher Weise dient z. B. auch eine gezielte Förderung eines internationalen Austausches von Nachwuchswissenschaftlern der internationalen Zusammenarbeit und hilft, die engeren fachlichen Verbindungen aufrechtzuerhalten, die von Emigranten nach dem Krieg wieder aufgenommen wurden.
Im Folgenden sind die zur Zeit laufenden internationalen Stipendien- und Austauschprogramme der Fritz Thyssen Stiftung aufgelistet. Förderungsanträge können nur unmittelbar bei den jeweiligen Institutionen gestellt werden.
- "Jürgen-Heideking-Fellowship" der Fritz Thyssen Stiftung für moderne und internationale Geschichte am Deutschen Historischen Institut in Washington, D.C.
- "Herzog-Ernst"-Gaststipendienprogramm am Forschungszentrum "Altes Buch/Alte Karte" Gotha-Erfurt
- "Clemens Heller"-Programm zur Förderung von Forschungsaufenthalten jüngerer französischer Wissenschaftler in Deutschland
- Geisteswissenschaftliches Stipendienprogramm an den Franckeschen Stiftungen
- Gaststipendienprogramm am Bologna Center of the Paul H. Nitze School of Advanced International Studies, The Johns Hopkins University, Bologna
- THESEUS
